самое простое: запустить
java -jar proguardgui.jar
input/output
-указать входной и выходной jar файлы
-указать где лежат clcd11.jar и midp20.jar
Shrinking
-ставим галочку напротив Midlets
Information
-Preverify
-Micro edition
-не помешает Target 1.3
а дальше Process!
В комплекте идет солидная справка.
Что забавно, пробовал на SMS_Bomber.jar пока не перепаковал его в TotalCommander прогвард ругался на проблемы с архивом
ЗЫ: говорят с версией 4.х есть проблемы, не всегода корректно работает