Рикаминдую использовать вот это вместо Акрониса:
http://partedmagic.com/doku.php и вообще рекомендую иметь "пожарную" загрузочную флешку с ним. И вообще я хотел написать на Булке развёрнутый пост про эту вещь, но что-то времени нет, надо собраться.
В основе этого "агрегата" GParted, у меня к нему доверия больше (были похожие симптомы с флешкой, только она не виделась даже на ХР (и всякие Партишн Меджики с Акронисами, соответственно, тоже её не видели, так вот GParted починил). Уверен, должно вылечиться обновлением разметки. Перед операциями всё же сохрани важные данные в надёжное место.