вот тут спецификация PE формата в винде (exe содержит pe)
http://www.microsoft.com/whdc/system...re/PECOFF.mspx
сам-то PE файл содержит код в инструкциях процессора, это уже надо идти к производителю и искать там спецификацию опкодов
для x86 можно тут посмотреть
http://x86asm.net/